Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde1Q9DBZ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syde1Q9DBZ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms