Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc97Q9DBT3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms