Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop5Q9DB28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms