Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc54Q9DAL3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms