Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Jam3Q9D8B7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Jam3Q9D8B7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms