Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fip1l1Q9D824 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms