Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Capns2Q9D7J7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms