Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn23Q9D7D7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms