Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbe1Q9D6Y9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbe1Q9D6Y9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms