Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
4930449I24RikQ9D5E3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
4930449I24RikQ9D5E3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
4930449I24RikQ9D5E3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms