Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc130Q9D516 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc130Q9D516 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms