Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931428L18RikQ9D4S9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms