Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms