Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms