Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag1Q9D3E6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms