Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700034E13RikQ9D2T6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms