Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pramef12Q9D2F1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms