Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nol3Q9D1X0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms