Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc18Q9CZJ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnajc18Q9CZJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms