Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ssu72Q9CY97 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ssu72Q9CY97 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms