Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChtopQ9CY57 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChtopQ9CY57 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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