Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tdrd12Q9CWU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tdrd12Q9CWU0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms