Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud1Q9CUB6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud1Q9CUB6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms