Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3kQ9CQZ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms