Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PclafQ9CQX4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PclafQ9CQX4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PclafQ9CQX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms