Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9CQF4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQF4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQF4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQF4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms