Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nudt21Q9CQF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nudt21Q9CQF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms