Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc18Q9CQ07 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc18Q9CQ07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms