Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cox6cQ9CPQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cox6cQ9CPQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms