Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcl11bQ99PV8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcl11bQ99PV8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcl11bQ99PV8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms