Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms