Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn6Q99PL6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn6Q99PL6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms