Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GpnmbQ99P91 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms