Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprtQ99M80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprtQ99M80 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PtprtQ99M80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprtQ99M80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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