Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc33a1Q99J27 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc33a1Q99J27 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc33a1Q99J27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc33a1Q99J27 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms