Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clip1Q922J3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clip1Q922J3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms