Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Basp1Q91XV3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Basp1Q91XV3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms