Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep57l1Q8VDS7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep57l1Q8VDS7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms