Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kdm4cQ8VCD7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm4cQ8VCD7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms