Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf3c5Q8R2T8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms