Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms