Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MyripQ8K3I4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms