Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms