Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Depp1Q8K2F3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms