Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms