Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms