Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nhsl1Q8CAF4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nhsl1Q8CAF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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