Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Podxl2Q8CAE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Podxl2Q8CAE9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podxl2Q8CAE9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms