Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp5Q8BX09 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms