Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.8 ms